馬爾他國家檔案館(馬爾他語:L-arkivji Nazzjonali ta' Malta)是地中海島嶼國家馬耳他的中央檔案館。馬爾他國家檔案館在以前一直位於大教長宮,並在1980年代後期搬遷至三個不同的地方。在法庭聽證會和裁決的檔案紀錄在1987年開始轉移到姆迪納班卡·朱拉塔利後,馬爾他國家檔案館法律文件分館在1988年成立;檔案館的戈佐島分館隨後成立。1994年,時任馬耳他總統烏戈·米夫蘇德·邦尼奇為位於拉巴特聖靈醫院的總館和主要設施揭幕。檔案館的所有館舍都設有供研究人員使用的閱覽室,並可以向能夠提供有效身份證明的16歲以上人士開放。近年來,馬爾他國家檔案館緊隨世界上多國的檔案館的步伐,一直在互聯網上增加其影響力。包括允許公眾在線搜索檔案紀錄,並查看對相關紀錄的內容的簡短描述。馬爾他國家檔案館其他相關工作包括:將檔案館的部分館藏電子化、在其網站上發佈其出版物、經其電子商店售賣檔案館館藏的副本,以及設立線上的馬爾他「國家回憶計劃」,使為馬爾他歷史作貢獻的人得以被銘記。