El Río Yanuncay es un río de Ecuador. Corre a lo largo de la ciudad de Cuenca y es el segundo más importante de los cuatro ríos que la atraviesan.El río nace al sur del Parque nacional Cajas, en los páramos de Angas a una altitud aproximada de 4000 m s. n. m., y pasa por la parte sur de la ciudad.Durante su paso por la ciudad de Cuenca, el Río Tarqui se une al Río Yanuncay, cerca de las calles Francisco Moscoso y 24 de mayo de la ciudad de Cuenca.